Pour les anglophiles, “JavaScript: The Definitive Guide” de David Flanagan et “JavaScript: The Good Parts” de Douglas Crockford sont probablement les meilleurs bouquins sur JS. Si on se concentre sur du JS côté client, “The Secret of the JavaScript Ninja”, de John Resig est assez bien, mais il faut avoir déjà de bonnes connaissances du langage.
Côté HTML/CSS, toujours pour les anglophiles, des livres plus petits : “HTML5 for Web Designers”, de Jeremy Keith, “CSS3 for Web Designers”, de Dan Cederholm, et concernant le Web mobile (mais pas que), “Responsive Web Design” de Ethan Marcotte et “Mobile First”, de Luke Wroblewski. Ces livres sont très probablement aussi disponibles en français.
Il faut que je farfouille dans ma bibliothèque personnelle pour voir ce que je pourrais ajouter.

Concernant l’achat de livres en informatique de manière générale, je vous conseille Eyrolles (à ~15 minutes de RER de la fac, ou sinon sur leur site Web, livraison gratuite pour ≥49€ d’achats), les vendeurs s’y connaissent et ils sont bien fournis. Quelques livres en anglais, et -5% si vous avez votre carte d’étudiant. Sinon, Gibert Joseph (à St Michel) a quelques bouquins mais leur rayon n’est pas très grand. Si vous êtes anglophiles, commandez sur Amazon US, vous bénéficiez de la conversion avantageuse de $/€, en ajoutant les frais de ports ça permet quand même d’avoir des livres un poil moins cher qu’en France, et surtout introuvables ici (beaucoup de bons livres ne sont disponibles qu’en anglais).